Målgruppen for Lundø er hjemmeboende børn og unge/voksne i alderen 0-23 år, med betydelig varig nedsat fysisk og psykisk funktionsevne, hvor der er behov for aflastning udenfor hjemmet.
Funktionsnedsættelserne kan skyldes diagnoser som downs syndrom, rett syndrom, speilmeyer voigt, multiple funktionsnedsættelser samt autisme eller lignende gennemgribende udviklingsforstyrrelser.
Mange har desuden kommunikative udfordringer, et stort plejebehov og et ikke alderssvarende kognitivt funktionsniveau.